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根据我国相关法律的规定和交易习惯，每日千分之三的违约金的计算方式一般是用本金乘以千分之三。违约金是合同经济方式的一种，也是对违约的一种经济制裁。违约金的设立，是为了保证债的履行，违约金的标准依法规定或双方在合同中书面约定。